L'organigramme est une représentation en silo qui réduit nécessairement la complexité du système à réaliser. Cette réduction de la complexité peut présenter l'avantage d'une simplification de la communication. Elle peut aussi devenir source de malentendu ou d'omission, lors de la phase de réalisation du projet, des interactions entre les sous-systèmes du produit. En cas de besoin, il est nécessaire de revenir aux résultats de l'analyse fonctionnelle et à la liste exhaustive des solutions.

Le choix des catégories permet de mettre plus ou moins en valeur certaines facettes du produit à réaliser.